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Le développement des nouvelles technologies à haut débit a permis de décrire en détail les tissus des patients à différents niveaux moléculaires et a provoqué un changement de praradigme en médecine, vers les traitements personnalisés. L'analyse informatique joue un rôle central dans l'intégration des différentes données du génome et dans la compréhension de la réponse cellulaire à un médicament. Selon ces données, il est possible de construire des modèles moléculaires qui comprennent les effets connus des molécules en aval du récepteur cible par le médicament ; cela permet un choix optimal lors des décisions thérapeutiques. Nous décrivons dans cet article les différentes étapes du cadre conceptuel de la modélisation informatique. Nous passons en revue les sources des informations sur les voies moléculaires, bases de construction des cartes d'interaction des modèles ; nous soulignons les concepts d'analyse de réseaux utiles pour identifier quelles configurations des maladies ont une valeur prédictive ; nous expliquons les idées de base de la modélisation cinétique. Enfin, nous illustrons ces concepts à l'aide d'études de la modélisation des cibles importantes influencées par les médicaments.