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PMC:7190488 / 404-4115 JSONTXT

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LitCovid-PD-FMA-UBERON

Id Subject Object Predicate Lexical cue fma_id
T1 308-311 Body_part denotes les http://purl.org/sig/ont/fma/fma63048
T2 1897-1902 Body_part denotes orale http://purl.org/sig/ont/fma/fma264767
T3 1904-1907 Body_part denotes Les http://purl.org/sig/ont/fma/fma63048
T4 2003-2006 Body_part denotes les http://purl.org/sig/ont/fma/fma63048
T5 2382-2385 Body_part denotes les http://purl.org/sig/ont/fma/fma63048
T6 2398-2401 Body_part denotes les http://purl.org/sig/ont/fma/fma63048
T7 2509-2512 Body_part denotes les http://purl.org/sig/ont/fma/fma63048
T8 2917-2920 Body_part denotes Les http://purl.org/sig/ont/fma/fma63048
T9 2948-2951 Body_part denotes Les http://purl.org/sig/ont/fma/fma63048
T10 3207-3210 Body_part denotes les http://purl.org/sig/ont/fma/fma63048
T11 3308-3311 Body_part denotes les http://purl.org/sig/ont/fma/fma63048
T12 3323-3326 Body_part denotes Les http://purl.org/sig/ont/fma/fma63048

LitCovid-PD-MONDO

Id Subject Object Predicate Lexical cue mondo_id
T2 1718-1727 Disease denotes infection http://purl.obolibrary.org/obo/MONDO_0005550
T3 1735-1743 Disease denotes SARS-CoV http://purl.obolibrary.org/obo/MONDO_0005091
T4 2131-2140 Disease denotes infection http://purl.obolibrary.org/obo/MONDO_0005550
T5 2148-2156 Disease denotes SARS-CoV http://purl.obolibrary.org/obo/MONDO_0005091
T6 3569-3577 Disease denotes SARS-CoV http://purl.obolibrary.org/obo/MONDO_0005091

LitCovid-PD-CLO

Id Subject Object Predicate Lexical cue
T2 6-8 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 denotes en
T3 29-31 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 denotes En
T4 155-156 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001020 denotes à
T5 426-427 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001020 denotes à
T6 428-430 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001382 denotes 48
T7 487-488 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001020 denotes à
T8 577-579 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 denotes en
T9 680-682 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 denotes En
T10 933-934 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001020 denotes à
T11 935-937 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001382 denotes 48
T12 985-987 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 denotes En
T13 1111-1113 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0008149 denotes Ne
T14 1127-1128 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001020 denotes à
T15 1378-1380 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 denotes En
T16 1583-1585 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0008149 denotes Ne
T17 1599-1600 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001020 denotes à
T18 1685-1687 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 denotes En
T19 1747-1749 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0008149 denotes ne
T20 2098-2100 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 denotes En
T21 2248-2250 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 denotes en
T22 2438-2439 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001020 denotes à
T23 2531-2533 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 denotes En
T24 2631-2633 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 denotes en
T25 2756-2758 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 denotes en
T26 2817-2819 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 denotes en
T27 2893-2895 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 denotes en
T28 3040-3042 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 denotes en
T29 3247-3250 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0002199 denotes car
T30 3464-3465 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001020 denotes à
T31 3612-3615 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001236 denotes 2 à

LitCovid-PD-CHEBI

Id Subject Object Predicate Lexical cue chebi_id
T1 6-8 Chemical denotes en http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_30347
T2 105-108 Chemical denotes Une http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_33361
T3 518-520 Chemical denotes La http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_33336
T4 577-579 Chemical denotes en http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_30347
T5 1061-1063 Chemical denotes Si http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_27573
T6 1111-1113 Chemical denotes Ne http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_33310
T7 1250-1253 Chemical denotes DXM http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_4470
T8 1256-1258 Chemical denotes Si http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_27573
T9 1332-1334 Chemical denotes Si http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_27573
T10 1503-1505 Chemical denotes Si http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_27573
T11 1583-1585 Chemical denotes Ne http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_33310
T12 1819-1821 Chemical denotes IV http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_74327
T13 2025-2027 Chemical denotes Si http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_27573
T14 2248-2250 Chemical denotes en http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_30347
T15 2631-2633 Chemical denotes en http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_30347
T16 2756-2758 Chemical denotes en http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_30347
T17 2817-2819 Chemical denotes en http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_30347
T18 2893-2895 Chemical denotes en http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_30347
T19 3040-3042 Chemical denotes en http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_30347
T20 3479-3481 Chemical denotes Si http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_27573

LitCovid-PD-GO-BP

Id Subject Object Predicate Lexical cue
T1 211-217 http://purl.obolibrary.org/obo/GO_0022810 denotes porter
T2 211-217 http://purl.obolibrary.org/obo/GO_0015297 denotes porter

LitCovid-sentences

Id Subject Object Predicate Lexical cue
T5 0-27 Sentence denotes Prise en charge ambulatoire
T6 29-92 Sentence denotes En cas de premier épisode d’uvéite antérieure ou récidive aiguë
T7 93-104 Sentence denotes Attention :
T8 105-261 Sentence denotes Une consultation pour œil rouge peut correspondre à une conjonctivite Covid-19 et il est indispensable de porter des gants lors de l’examen de ces patients.
T9 262-379 Sentence denotes Le fond d’œil est indispensable pour éliminer les causes infectieuses classiques pouvant imposer une hospitalisation.
T10 380-517 Sentence denotes Il faut maintenir la consultation de contrôle à 48–72 heures (ou une semaine) puis la téléconsultation est à privilégier si amélioration.
T11 518-679 Sentence denotes La corticothérapie collyre n’est pas contre-indiquée, tout en favorisant une décroissance très lente de la corticothérapie afin d’éviter un rebond inflammatoire.
T12 680-852 Sentence denotes En l’absence de signe général, ou d’immunodépression, avec atteinte unilatérale et amélioration rapide : le bilan étiologique pourra être réalisé sans urgence dans le mois.
T13 853-983 Sentence denotes Signe général, immunosuppression, atteinte bilatérale ou absence d’amélioration à 48 h : un bilan étiologique rapide est envisagé.
T14 985-1060 Sentence denotes En cas d’uvéite antérieure suivie et traitée par collyres corticoïdes seuls
T15 1061-1089 Sentence denotes Si l'uvéite est stabilisée :
T16 1090-1110 Sentence denotes Pas de consultation.
T17 1111-1255 Sentence denotes Ne pas procéder à la décroissance des corticoïdes topiques et garder le nombre minimal de gouttes ayant permis l’accalmie (si < 5gtes/j de DXM).
T18 1256-1331 Sentence denotes Si PIO limite (> 20 mmHg) un hypotonisant prophylactique peut être proposé.
T19 1332-1377 Sentence denotes Si l'uvéite est non contrôlée : consultation.
T20 1378-1502 Sentence denotes En cas d’uvéite ou sclérite suivie et traitée par corticoïdes systémiques et/ou immunosuppresseurs et/ou agents biologiques.
T21 1503-1561 Sentence denotes Si uvéite chronique ou sclérite chronique ou stabilisées :
T22 1562-1582 Sentence denotes Pas de consultation.
T23 1583-1684 Sentence denotes Ne pas procéder à la décroissance des corticoïdes et garder la dose minimale ayant permis l’accalmie.
T24 1685-1903 Sentence denotes En l’absence d’argument pour une infection par le SARS-CoV-2, ne pas différer l’administration des immunosuppresseurs ou biothérapies IV s’il n’est pas possible de traiter l’inflammation par voie sous cutanée ou orale.
T25 1904-2024 Sentence denotes Les bilans sanguins de contrôle de la tolérance doivent être espacés si possible (si normalité sur les 2 derniers mois).
T26 2025-2083 Sentence denotes Si uvéite/sclérite non contrôlée ou avec menace visuelle :
T27 2084-2097 Sentence denotes Consultation.
T28 2098-2376 Sentence denotes En l’absence d’argument pour une infection par le SARS-CoV-2, des traitements anti-infectieux ou bolus de méthylprednisolone peuvent être administrés en hospitalisation après avoir pesé la balance bénéfice/risque (monophtalme, atteinte maculaire sévère ou du nerf optique etc…).
T29 2377-2529 Sentence denotes Dans les autres cas, les traitements stéroïdes locaux seront à privilégier pour permettre de différer le traitement systémique chez les patients Covid+.
T30 2531-2599 Sentence denotes En cas de kérato-uvéite herpétique ou rétinochoroïdite toxoplasmique
T31 2600-2749 Sentence denotes Pour le premier épisode : mise en route du traitement avec rythme de surveillance adapté au cas par cas et si possible sans corticothérapie associée.
T32 2750-2797 Sentence denotes Prise en charge spécialisée si menace visuelle.
T33 2798-2915 Sentence denotes Instaurer un suivi en téléconsultation pour modulation thérapeutique avec le cas échéant prise en charge spécialisée.
T34 2917-2947 Sentence denotes Les injections intravitréennes
T35 2948-3082 Sentence denotes Les IVT de corticoïdes pour œdème maculaire ou hyalite peuvent théoriquement être différées en l’absence de menace visuelle immédiate.
T36 3083-3194 Sentence denotes Elles seront discutées si situation d’urgence chez un patient Covid+ contre-indiquant le traitement systémique.
T37 3195-3322 Sentence denotes Privilégier les IVT aux injections sous-ténoniennes car la diffusion extraoculaire sanguine est quasi-nulle avec les premières.
T38 3323-3418 Sentence denotes Les IVT d’anti VEGF pour néovascularisation choroïdienne inflammatoire doivent être maintenues.
T39 3419-3478 Sentence denotes Comme pour la myopie forte un régime PRN est à privilégier.
T40 3479-3711 Sentence denotes Si impossibilité d’examiner le patient avant IVT (pour limiter le risque de contracter le SARS-CoV-2), un régime fixe mensuel court (2 à 3 mois maximum) peut être choisi si une seule IVT n’induit pas d’amélioration visuelle notable.

LitCovid-PubTator

Id Subject Object Predicate Lexical cue tao:has_database_id
10 252-260 Species denotes patients Tax:9606
11 175-183 Disease denotes Covid-19 MESH:C000657245
13 308-311 Gene denotes les Gene:2525
15 716-732 Disease denotes immunodépression
17 1285-1297 Disease denotes hypotonisant
23 2003-2006 Gene denotes les Gene:2525
24 1904-1907 Gene denotes Les Gene:2525
25 1735-1745 Species denotes SARS-CoV-2 Tax:2697049
26 1718-1727 Disease denotes infection MESH:D007239
27 1859-1871 Disease denotes inflammation MESH:D007249
36 2509-2512 Gene denotes les Gene:2525
37 2398-2401 Gene denotes les Gene:2525
38 2382-2385 Gene denotes les Gene:2525
39 2148-2158 Species denotes SARS-CoV-2 Tax:2697049
40 2513-2521 Species denotes patients Tax:9606
41 2414-2423 Chemical denotes stéroïdes
42 2131-2140 Disease denotes infection MESH:D007239
43 2522-2527 Disease denotes Covid MESH:C000657245
45 2917-2920 Gene denotes Les Gene:2525
51 2948-2951 Gene denotes Les Gene:2525
52 3308-3311 Gene denotes les Gene:2525
53 3207-3210 Gene denotes les Gene:2525
54 3137-3144 Species denotes patient Tax:9606
55 3145-3150 Disease denotes Covid MESH:C000657245
62 3338-3342 Gene denotes VEGF Gene:7422
63 3323-3326 Gene denotes Les Gene:2525
64 3510-3517 Species denotes patient Tax:9606
65 3569-3579 Species denotes SARS-CoV-2 Tax:2697049
66 3348-3393 Disease denotes néovascularisation choroïdienne inflammatoire
67 3642-3651 Disease denotes choisi si MESH:C538139