PMC:7190488 / 404-4115
Annnotations
LitCovid-PD-FMA-UBERON
| Id | Subject | Object | Predicate | Lexical cue | fma_id |
|---|---|---|---|---|---|
| T1 | 308-311 | Body_part | denotes | les | http://purl.org/sig/ont/fma/fma63048 |
| T2 | 1897-1902 | Body_part | denotes | orale | http://purl.org/sig/ont/fma/fma264767 |
| T3 | 1904-1907 | Body_part | denotes | Les | http://purl.org/sig/ont/fma/fma63048 |
| T4 | 2003-2006 | Body_part | denotes | les | http://purl.org/sig/ont/fma/fma63048 |
| T5 | 2382-2385 | Body_part | denotes | les | http://purl.org/sig/ont/fma/fma63048 |
| T6 | 2398-2401 | Body_part | denotes | les | http://purl.org/sig/ont/fma/fma63048 |
| T7 | 2509-2512 | Body_part | denotes | les | http://purl.org/sig/ont/fma/fma63048 |
| T8 | 2917-2920 | Body_part | denotes | Les | http://purl.org/sig/ont/fma/fma63048 |
| T9 | 2948-2951 | Body_part | denotes | Les | http://purl.org/sig/ont/fma/fma63048 |
| T10 | 3207-3210 | Body_part | denotes | les | http://purl.org/sig/ont/fma/fma63048 |
| T11 | 3308-3311 | Body_part | denotes | les | http://purl.org/sig/ont/fma/fma63048 |
| T12 | 3323-3326 | Body_part | denotes | Les | http://purl.org/sig/ont/fma/fma63048 |
LitCovid-PD-MONDO
| Id | Subject | Object | Predicate | Lexical cue | mondo_id |
|---|---|---|---|---|---|
| T2 | 1718-1727 | Disease | denotes | infection | http://purl.obolibrary.org/obo/MONDO_0005550 |
| T3 | 1735-1743 | Disease | denotes | SARS-CoV | http://purl.obolibrary.org/obo/MONDO_0005091 |
| T4 | 2131-2140 | Disease | denotes | infection | http://purl.obolibrary.org/obo/MONDO_0005550 |
| T5 | 2148-2156 | Disease | denotes | SARS-CoV | http://purl.obolibrary.org/obo/MONDO_0005091 |
| T6 | 3569-3577 | Disease | denotes | SARS-CoV | http://purl.obolibrary.org/obo/MONDO_0005091 |
LitCovid-PD-CLO
| Id | Subject | Object | Predicate | Lexical cue |
|---|---|---|---|---|
| T2 | 6-8 | http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 | denotes | en |
| T3 | 29-31 | http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 | denotes | En |
| T4 | 155-156 | http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001020 | denotes | à |
| T5 | 426-427 | http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001020 | denotes | à |
| T6 | 428-430 | http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001382 | denotes | 48 |
| T7 | 487-488 | http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001020 | denotes | à |
| T8 | 577-579 | http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 | denotes | en |
| T9 | 680-682 | http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 | denotes | En |
| T10 | 933-934 | http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001020 | denotes | à |
| T11 | 935-937 | http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001382 | denotes | 48 |
| T12 | 985-987 | http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 | denotes | En |
| T13 | 1111-1113 | http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0008149 | denotes | Ne |
| T14 | 1127-1128 | http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001020 | denotes | à |
| T15 | 1378-1380 | http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 | denotes | En |
| T16 | 1583-1585 | http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0008149 | denotes | Ne |
| T17 | 1599-1600 | http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001020 | denotes | à |
| T18 | 1685-1687 | http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 | denotes | En |
| T19 | 1747-1749 | http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0008149 | denotes | ne |
| T20 | 2098-2100 | http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 | denotes | En |
| T21 | 2248-2250 | http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 | denotes | en |
| T22 | 2438-2439 | http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001020 | denotes | à |
| T23 | 2531-2533 | http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 | denotes | En |
| T24 | 2631-2633 | http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 | denotes | en |
| T25 | 2756-2758 | http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 | denotes | en |
| T26 | 2817-2819 | http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 | denotes | en |
| T27 | 2893-2895 | http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 | denotes | en |
| T28 | 3040-3042 | http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 | denotes | en |
| T29 | 3247-3250 | http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0002199 | denotes | car |
| T30 | 3464-3465 | http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001020 | denotes | à |
| T31 | 3612-3615 | http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001236 | denotes | 2 à |
LitCovid-PD-CHEBI
| Id | Subject | Object | Predicate | Lexical cue | chebi_id |
|---|---|---|---|---|---|
| T1 | 6-8 | Chemical | denotes | en | http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_30347 |
| T2 | 105-108 | Chemical | denotes | Une | http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_33361 |
| T3 | 518-520 | Chemical | denotes | La | http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_33336 |
| T4 | 577-579 | Chemical | denotes | en | http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_30347 |
| T5 | 1061-1063 | Chemical | denotes | Si | http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_27573 |
| T6 | 1111-1113 | Chemical | denotes | Ne | http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_33310 |
| T7 | 1250-1253 | Chemical | denotes | DXM | http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_4470 |
| T8 | 1256-1258 | Chemical | denotes | Si | http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_27573 |
| T9 | 1332-1334 | Chemical | denotes | Si | http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_27573 |
| T10 | 1503-1505 | Chemical | denotes | Si | http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_27573 |
| T11 | 1583-1585 | Chemical | denotes | Ne | http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_33310 |
| T12 | 1819-1821 | Chemical | denotes | IV | http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_74327 |
| T13 | 2025-2027 | Chemical | denotes | Si | http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_27573 |
| T14 | 2248-2250 | Chemical | denotes | en | http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_30347 |
| T15 | 2631-2633 | Chemical | denotes | en | http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_30347 |
| T16 | 2756-2758 | Chemical | denotes | en | http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_30347 |
| T17 | 2817-2819 | Chemical | denotes | en | http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_30347 |
| T18 | 2893-2895 | Chemical | denotes | en | http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_30347 |
| T19 | 3040-3042 | Chemical | denotes | en | http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_30347 |
| T20 | 3479-3481 | Chemical | denotes | Si | http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_27573 |
LitCovid-PD-GO-BP
| Id | Subject | Object | Predicate | Lexical cue |
|---|---|---|---|---|
| T1 | 211-217 | http://purl.obolibrary.org/obo/GO_0022810 | denotes | porter |
| T2 | 211-217 | http://purl.obolibrary.org/obo/GO_0015297 | denotes | porter |
LitCovid-sentences
| Id | Subject | Object | Predicate | Lexical cue |
|---|---|---|---|---|
| T5 | 0-27 | Sentence | denotes | Prise en charge ambulatoire |
| T6 | 29-92 | Sentence | denotes | En cas de premier épisode d’uvéite antérieure ou récidive aiguë |
| T7 | 93-104 | Sentence | denotes | Attention : |
| T8 | 105-261 | Sentence | denotes | Une consultation pour œil rouge peut correspondre à une conjonctivite Covid-19 et il est indispensable de porter des gants lors de l’examen de ces patients. |
| T9 | 262-379 | Sentence | denotes | Le fond d’œil est indispensable pour éliminer les causes infectieuses classiques pouvant imposer une hospitalisation. |
| T10 | 380-517 | Sentence | denotes | Il faut maintenir la consultation de contrôle à 48–72 heures (ou une semaine) puis la téléconsultation est à privilégier si amélioration. |
| T11 | 518-679 | Sentence | denotes | La corticothérapie collyre n’est pas contre-indiquée, tout en favorisant une décroissance très lente de la corticothérapie afin d’éviter un rebond inflammatoire. |
| T12 | 680-852 | Sentence | denotes | En l’absence de signe général, ou d’immunodépression, avec atteinte unilatérale et amélioration rapide : le bilan étiologique pourra être réalisé sans urgence dans le mois. |
| T13 | 853-983 | Sentence | denotes | Signe général, immunosuppression, atteinte bilatérale ou absence d’amélioration à 48 h : un bilan étiologique rapide est envisagé. |
| T14 | 985-1060 | Sentence | denotes | En cas d’uvéite antérieure suivie et traitée par collyres corticoïdes seuls |
| T15 | 1061-1089 | Sentence | denotes | Si l'uvéite est stabilisée : |
| T16 | 1090-1110 | Sentence | denotes | Pas de consultation. |
| T17 | 1111-1255 | Sentence | denotes | Ne pas procéder à la décroissance des corticoïdes topiques et garder le nombre minimal de gouttes ayant permis l’accalmie (si < 5gtes/j de DXM). |
| T18 | 1256-1331 | Sentence | denotes | Si PIO limite (> 20 mmHg) un hypotonisant prophylactique peut être proposé. |
| T19 | 1332-1377 | Sentence | denotes | Si l'uvéite est non contrôlée : consultation. |
| T20 | 1378-1502 | Sentence | denotes | En cas d’uvéite ou sclérite suivie et traitée par corticoïdes systémiques et/ou immunosuppresseurs et/ou agents biologiques. |
| T21 | 1503-1561 | Sentence | denotes | Si uvéite chronique ou sclérite chronique ou stabilisées : |
| T22 | 1562-1582 | Sentence | denotes | Pas de consultation. |
| T23 | 1583-1684 | Sentence | denotes | Ne pas procéder à la décroissance des corticoïdes et garder la dose minimale ayant permis l’accalmie. |
| T24 | 1685-1903 | Sentence | denotes | En l’absence d’argument pour une infection par le SARS-CoV-2, ne pas différer l’administration des immunosuppresseurs ou biothérapies IV s’il n’est pas possible de traiter l’inflammation par voie sous cutanée ou orale. |
| T25 | 1904-2024 | Sentence | denotes | Les bilans sanguins de contrôle de la tolérance doivent être espacés si possible (si normalité sur les 2 derniers mois). |
| T26 | 2025-2083 | Sentence | denotes | Si uvéite/sclérite non contrôlée ou avec menace visuelle : |
| T27 | 2084-2097 | Sentence | denotes | Consultation. |
| T28 | 2098-2376 | Sentence | denotes | En l’absence d’argument pour une infection par le SARS-CoV-2, des traitements anti-infectieux ou bolus de méthylprednisolone peuvent être administrés en hospitalisation après avoir pesé la balance bénéfice/risque (monophtalme, atteinte maculaire sévère ou du nerf optique etc…). |
| T29 | 2377-2529 | Sentence | denotes | Dans les autres cas, les traitements stéroïdes locaux seront à privilégier pour permettre de différer le traitement systémique chez les patients Covid+. |
| T30 | 2531-2599 | Sentence | denotes | En cas de kérato-uvéite herpétique ou rétinochoroïdite toxoplasmique |
| T31 | 2600-2749 | Sentence | denotes | Pour le premier épisode : mise en route du traitement avec rythme de surveillance adapté au cas par cas et si possible sans corticothérapie associée. |
| T32 | 2750-2797 | Sentence | denotes | Prise en charge spécialisée si menace visuelle. |
| T33 | 2798-2915 | Sentence | denotes | Instaurer un suivi en téléconsultation pour modulation thérapeutique avec le cas échéant prise en charge spécialisée. |
| T34 | 2917-2947 | Sentence | denotes | Les injections intravitréennes |
| T35 | 2948-3082 | Sentence | denotes | Les IVT de corticoïdes pour œdème maculaire ou hyalite peuvent théoriquement être différées en l’absence de menace visuelle immédiate. |
| T36 | 3083-3194 | Sentence | denotes | Elles seront discutées si situation d’urgence chez un patient Covid+ contre-indiquant le traitement systémique. |
| T37 | 3195-3322 | Sentence | denotes | Privilégier les IVT aux injections sous-ténoniennes car la diffusion extraoculaire sanguine est quasi-nulle avec les premières. |
| T38 | 3323-3418 | Sentence | denotes | Les IVT d’anti VEGF pour néovascularisation choroïdienne inflammatoire doivent être maintenues. |
| T39 | 3419-3478 | Sentence | denotes | Comme pour la myopie forte un régime PRN est à privilégier. |
| T40 | 3479-3711 | Sentence | denotes | Si impossibilité d’examiner le patient avant IVT (pour limiter le risque de contracter le SARS-CoV-2), un régime fixe mensuel court (2 à 3 mois maximum) peut être choisi si une seule IVT n’induit pas d’amélioration visuelle notable. |
LitCovid-PubTator
| Id | Subject | Object | Predicate | Lexical cue | tao:has_database_id |
|---|---|---|---|---|---|
| 10 | 252-260 | Species | denotes | patients | Tax:9606 |
| 11 | 175-183 | Disease | denotes | Covid-19 | MESH:C000657245 |
| 13 | 308-311 | Gene | denotes | les | Gene:2525 |
| 15 | 716-732 | Disease | denotes | immunodépression | |
| 17 | 1285-1297 | Disease | denotes | hypotonisant | |
| 23 | 2003-2006 | Gene | denotes | les | Gene:2525 |
| 24 | 1904-1907 | Gene | denotes | Les | Gene:2525 |
| 25 | 1735-1745 | Species | denotes | SARS-CoV-2 | Tax:2697049 |
| 26 | 1718-1727 | Disease | denotes | infection | MESH:D007239 |
| 27 | 1859-1871 | Disease | denotes | inflammation | MESH:D007249 |
| 36 | 2509-2512 | Gene | denotes | les | Gene:2525 |
| 37 | 2398-2401 | Gene | denotes | les | Gene:2525 |
| 38 | 2382-2385 | Gene | denotes | les | Gene:2525 |
| 39 | 2148-2158 | Species | denotes | SARS-CoV-2 | Tax:2697049 |
| 40 | 2513-2521 | Species | denotes | patients | Tax:9606 |
| 41 | 2414-2423 | Chemical | denotes | stéroïdes | |
| 42 | 2131-2140 | Disease | denotes | infection | MESH:D007239 |
| 43 | 2522-2527 | Disease | denotes | Covid | MESH:C000657245 |
| 45 | 2917-2920 | Gene | denotes | Les | Gene:2525 |
| 51 | 2948-2951 | Gene | denotes | Les | Gene:2525 |
| 52 | 3308-3311 | Gene | denotes | les | Gene:2525 |
| 53 | 3207-3210 | Gene | denotes | les | Gene:2525 |
| 54 | 3137-3144 | Species | denotes | patient | Tax:9606 |
| 55 | 3145-3150 | Disease | denotes | Covid | MESH:C000657245 |
| 62 | 3338-3342 | Gene | denotes | VEGF | Gene:7422 |
| 63 | 3323-3326 | Gene | denotes | Les | Gene:2525 |
| 64 | 3510-3517 | Species | denotes | patient | Tax:9606 |
| 65 | 3569-3579 | Species | denotes | SARS-CoV-2 | Tax:2697049 |
| 66 | 3348-3393 | Disease | denotes | néovascularisation choroïdienne inflammatoire | |
| 67 | 3642-3651 | Disease | denotes | choisi si | MESH:C538139 |