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PMC:7224657 / 8949-10615 JSONTXT

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LitCovid-PubTator

Id Subject Object Predicate Lexical cue tao:has_database_id
141 1230-1233 Gene denotes sur Gene:6833
142 1202-1205 Gene denotes Les Gene:2525
143 853-856 Gene denotes les Gene:2525
144 795-798 Gene denotes les Gene:2525
145 237-240 Gene denotes les Gene:2525
146 241-249 Species denotes patients Tax:9606
147 386-396 Species denotes SARS-CoV-2 Tax:2697049
148 628-635 Species denotes patient Tax:9606
149 799-807 Species denotes patients Tax:9606
150 857-865 Species denotes patients Tax:9606
151 43-51 Disease denotes COVID-19 MESH:C000657245
152 221-229 Disease denotes COVID-19 MESH:C000657245
153 269-288 Disease denotes atteints de cancers MESH:D009369
155 374-383 Disease denotes infection MESH:D007239

LitCovid-PD-FMA-UBERON

Id Subject Object Predicate Lexical cue fma_id
T11 237-240 Body_part denotes les http://purl.org/sig/ont/fma/fma63048
T12 795-798 Body_part denotes les http://purl.org/sig/ont/fma/fma63048
T13 853-856 Body_part denotes les http://purl.org/sig/ont/fma/fma63048
T14 1202-1205 Body_part denotes Les http://purl.org/sig/ont/fma/fma63048

LitCovid-PD-MONDO

Id Subject Object Predicate Lexical cue mondo_id
T35 43-51 Disease denotes COVID-19 http://purl.obolibrary.org/obo/MONDO_0100096
T36 221-229 Disease denotes COVID-19 http://purl.obolibrary.org/obo/MONDO_0100096
T37 386-394 Disease denotes SARS-CoV http://purl.obolibrary.org/obo/MONDO_0005091

LitCovid-PD-CLO

Id Subject Object Predicate Lexical cue
T76 65-66 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001020 denotes a
T77 169-170 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001020 denotes a
T78 192-193 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001020 denotes à
T79 384-385 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001020 denotes à
T80 395-398 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001236 denotes 2 à
T81 465-467 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001382 denotes 48
T82 570-571 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001020 denotes à
T83 572-574 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001382 denotes 48
T84 597-599 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 denotes En
T85 682-684 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 denotes En
T86 881-882 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001020 denotes à
T87 1094-1095 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001020 denotes à
T88 1107-1109 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 denotes En
T89 1206-1211 http://purl.obolibrary.org/obo/UBERON_0000473 denotes tests
T90 1293-1294 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001020 denotes à
T91 1315-1317 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0008149 denotes ne
T92 1335-1336 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001020 denotes à
T93 1472-1473 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001020 denotes à
T94 1513-1514 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001020 denotes à
T95 1606-1611 http://purl.obolibrary.org/obo/NCBITaxon_10239 denotes virus
T96 1647-1652 http://purl.obolibrary.org/obo/UBERON_0000473 denotes tests

LitCovid-PD-CHEBI

Id Subject Object Predicate Lexical cue chebi_id
T40 518-521 Chemical denotes Une http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_33361

LitCovid-sentences

Id Subject Object Predicate Lexical cue
T58 0-303 Sentence denotes Afin de mieux estimer le risque infectieux COVID-19, la SFAR [8] a édité des recommandations concernant le dépistage systématique pré-opératoire le 29/04/2020 et l’HCSP a défini des personnes à risque de formes graves de COVID-19, comme les patients de plus de 70 ans, atteints de cancers et obèses [9].
T59 304-517 Sentence denotes Il est désormais recommandé de rechercher des symptômes compatibles d’infection à SARS-CoV-2 à l’aide d’un questionnaire standardisé au moment de l’admission et 48-72 h avant l’intervention par appel téléphonique.
T60 518-596 Sentence denotes Une PCR par frottis naso- pharyngée est réalisée 24 à 48 h avant la chirurgie.
T61 597-681 Sentence denotes En cas de PCR négative chez un patient asymptomatique, l’intervention est maintenue.
T62 682-923 Sentence denotes En cas de PCR positive et/ou de tableau clinique évocateur, l’intervention est reportée d’au moins 14 jours chez les patients immunocompétents et d’au moins 24 jours chez les patients immunodéprimés à compter de la disparition des symptômes.
T63 924-1106 Sentence denotes Il faut cependant rester vigilant concernant la fiabilité de la PCR par frottis naso- pharyngé, qui présente une faible sensibilité, avec un taux de faux négatifs estimé à 37 % [10].
T64 1107-1201 Sentence denotes En cas de doute ou de facteurs de risque, un scanner thoracique pourra également être réalisé.
T65 1202-1393 Sentence denotes Les tests sanguins reposant sur la sérologie et la recherche d’anticorps sont actuellement à la phase d’étude et ne peuvent donc pas à ce jour être positionnés dans l’algorithme diagnostique.
T66 1394-1666 Sentence denotes Même si un dépistage systématique pré-opératoire est légitime, il faut garder à l’esprit que ses modalités sont encore à définir et risquent de se modifier dans le temps selon l’évolution de nos connaissances du virus et des performances des différents tests de dépistage.