PMC:7224657 / 8949-10615
Annnotations
LitCovid-PubTator
Id | Subject | Object | Predicate | Lexical cue | tao:has_database_id |
---|---|---|---|---|---|
141 | 1230-1233 | Gene | denotes | sur | Gene:6833 |
142 | 1202-1205 | Gene | denotes | Les | Gene:2525 |
143 | 853-856 | Gene | denotes | les | Gene:2525 |
144 | 795-798 | Gene | denotes | les | Gene:2525 |
145 | 237-240 | Gene | denotes | les | Gene:2525 |
146 | 241-249 | Species | denotes | patients | Tax:9606 |
147 | 386-396 | Species | denotes | SARS-CoV-2 | Tax:2697049 |
148 | 628-635 | Species | denotes | patient | Tax:9606 |
149 | 799-807 | Species | denotes | patients | Tax:9606 |
150 | 857-865 | Species | denotes | patients | Tax:9606 |
151 | 43-51 | Disease | denotes | COVID-19 | MESH:C000657245 |
152 | 221-229 | Disease | denotes | COVID-19 | MESH:C000657245 |
153 | 269-288 | Disease | denotes | atteints de cancers | MESH:D009369 |
155 | 374-383 | Disease | denotes | infection | MESH:D007239 |
LitCovid-PD-FMA-UBERON
Id | Subject | Object | Predicate | Lexical cue | fma_id |
---|---|---|---|---|---|
T11 | 237-240 | Body_part | denotes | les | http://purl.org/sig/ont/fma/fma63048 |
T12 | 795-798 | Body_part | denotes | les | http://purl.org/sig/ont/fma/fma63048 |
T13 | 853-856 | Body_part | denotes | les | http://purl.org/sig/ont/fma/fma63048 |
T14 | 1202-1205 | Body_part | denotes | Les | http://purl.org/sig/ont/fma/fma63048 |
LitCovid-PD-MONDO
Id | Subject | Object | Predicate | Lexical cue | mondo_id |
---|---|---|---|---|---|
T35 | 43-51 | Disease | denotes | COVID-19 | http://purl.obolibrary.org/obo/MONDO_0100096 |
T36 | 221-229 | Disease | denotes | COVID-19 | http://purl.obolibrary.org/obo/MONDO_0100096 |
T37 | 386-394 | Disease | denotes | SARS-CoV | http://purl.obolibrary.org/obo/MONDO_0005091 |
LitCovid-PD-CLO
Id | Subject | Object | Predicate | Lexical cue |
---|---|---|---|---|
T76 | 65-66 | http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001020 | denotes | a |
T77 | 169-170 | http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001020 | denotes | a |
T78 | 192-193 | http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001020 | denotes | à |
T79 | 384-385 | http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001020 | denotes | à |
T80 | 395-398 | http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001236 | denotes | 2 à |
T81 | 465-467 | http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001382 | denotes | 48 |
T82 | 570-571 | http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001020 | denotes | à |
T83 | 572-574 | http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001382 | denotes | 48 |
T84 | 597-599 | http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 | denotes | En |
T85 | 682-684 | http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 | denotes | En |
T86 | 881-882 | http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001020 | denotes | à |
T87 | 1094-1095 | http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001020 | denotes | à |
T88 | 1107-1109 | http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 | denotes | En |
T89 | 1206-1211 | http://purl.obolibrary.org/obo/UBERON_0000473 | denotes | tests |
T90 | 1293-1294 | http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001020 | denotes | à |
T91 | 1315-1317 | http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0008149 | denotes | ne |
T92 | 1335-1336 | http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001020 | denotes | à |
T93 | 1472-1473 | http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001020 | denotes | à |
T94 | 1513-1514 | http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001020 | denotes | à |
T95 | 1606-1611 | http://purl.obolibrary.org/obo/NCBITaxon_10239 | denotes | virus |
T96 | 1647-1652 | http://purl.obolibrary.org/obo/UBERON_0000473 | denotes | tests |
LitCovid-PD-CHEBI
Id | Subject | Object | Predicate | Lexical cue | chebi_id |
---|---|---|---|---|---|
T40 | 518-521 | Chemical | denotes | Une | http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_33361 |
LitCovid-sentences
Id | Subject | Object | Predicate | Lexical cue |
---|---|---|---|---|
T58 | 0-303 | Sentence | denotes | Afin de mieux estimer le risque infectieux COVID-19, la SFAR [8] a édité des recommandations concernant le dépistage systématique pré-opératoire le 29/04/2020 et l’HCSP a défini des personnes à risque de formes graves de COVID-19, comme les patients de plus de 70 ans, atteints de cancers et obèses [9]. |
T59 | 304-517 | Sentence | denotes | Il est désormais recommandé de rechercher des symptômes compatibles d’infection à SARS-CoV-2 à l’aide d’un questionnaire standardisé au moment de l’admission et 48-72 h avant l’intervention par appel téléphonique. |
T60 | 518-596 | Sentence | denotes | Une PCR par frottis naso- pharyngée est réalisée 24 à 48 h avant la chirurgie. |
T61 | 597-681 | Sentence | denotes | En cas de PCR négative chez un patient asymptomatique, l’intervention est maintenue. |
T62 | 682-923 | Sentence | denotes | En cas de PCR positive et/ou de tableau clinique évocateur, l’intervention est reportée d’au moins 14 jours chez les patients immunocompétents et d’au moins 24 jours chez les patients immunodéprimés à compter de la disparition des symptômes. |
T63 | 924-1106 | Sentence | denotes | Il faut cependant rester vigilant concernant la fiabilité de la PCR par frottis naso- pharyngé, qui présente une faible sensibilité, avec un taux de faux négatifs estimé à 37 % [10]. |
T64 | 1107-1201 | Sentence | denotes | En cas de doute ou de facteurs de risque, un scanner thoracique pourra également être réalisé. |
T65 | 1202-1393 | Sentence | denotes | Les tests sanguins reposant sur la sérologie et la recherche d’anticorps sont actuellement à la phase d’étude et ne peuvent donc pas à ce jour être positionnés dans l’algorithme diagnostique. |
T66 | 1394-1666 | Sentence | denotes | Même si un dépistage systématique pré-opératoire est légitime, il faut garder à l’esprit que ses modalités sont encore à définir et risquent de se modifier dans le temps selon l’évolution de nos connaissances du virus et des performances des différents tests de dépistage. |