> top > docs > PMC:7190488 > spans > 173-6382 > annotations

PMC:7190488 / 173-6382 JSONTXT

Annnotations TAB JSON ListView MergeView

LitCovid-PD-FMA-UBERON

Id Subject Object Predicate Lexical cue fma_id
T1 539-542 Body_part denotes les http://purl.org/sig/ont/fma/fma63048
T2 2128-2133 Body_part denotes orale http://purl.org/sig/ont/fma/fma264767
T3 2135-2138 Body_part denotes Les http://purl.org/sig/ont/fma/fma63048
T4 2234-2237 Body_part denotes les http://purl.org/sig/ont/fma/fma63048
T5 2613-2616 Body_part denotes les http://purl.org/sig/ont/fma/fma63048
T6 2629-2632 Body_part denotes les http://purl.org/sig/ont/fma/fma63048
T7 2740-2743 Body_part denotes les http://purl.org/sig/ont/fma/fma63048
T8 3148-3151 Body_part denotes Les http://purl.org/sig/ont/fma/fma63048
T9 3179-3182 Body_part denotes Les http://purl.org/sig/ont/fma/fma63048
T10 3438-3441 Body_part denotes les http://purl.org/sig/ont/fma/fma63048
T11 3539-3542 Body_part denotes les http://purl.org/sig/ont/fma/fma63048
T12 3554-3557 Body_part denotes Les http://purl.org/sig/ont/fma/fma63048
T13 4584-4587 Body_part denotes les http://purl.org/sig/ont/fma/fma63048
T14 4730-4733 Body_part denotes les http://purl.org/sig/ont/fma/fma63048
T15 4844-4847 Body_part denotes les http://purl.org/sig/ont/fma/fma63048
T16 5550-5553 Body_part denotes les http://purl.org/sig/ont/fma/fma63048
T17 5692-5695 Body_part denotes les http://purl.org/sig/ont/fma/fma63048
T18 5860-5863 Body_part denotes les http://purl.org/sig/ont/fma/fma63048
T19 6154-6157 Body_part denotes Les http://purl.org/sig/ont/fma/fma63048

LitCovid-PD-MONDO

Id Subject Object Predicate Lexical cue mondo_id
T2 1949-1958 Disease denotes infection http://purl.obolibrary.org/obo/MONDO_0005550
T3 1966-1974 Disease denotes SARS-CoV http://purl.obolibrary.org/obo/MONDO_0005091
T4 2362-2371 Disease denotes infection http://purl.obolibrary.org/obo/MONDO_0005550
T5 2379-2387 Disease denotes SARS-CoV http://purl.obolibrary.org/obo/MONDO_0005091
T6 3800-3808 Disease denotes SARS-CoV http://purl.obolibrary.org/obo/MONDO_0005091
T7 5219-5227 Disease denotes SARS-CoV http://purl.obolibrary.org/obo/MONDO_0005091

LitCovid-PD-CLO

Id Subject Object Predicate Lexical cue
T2 237-239 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 denotes en
T3 260-262 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 denotes En
T4 386-387 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001020 denotes à
T5 657-658 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001020 denotes à
T6 659-661 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001382 denotes 48
T7 718-719 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001020 denotes à
T8 808-810 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 denotes en
T9 911-913 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 denotes En
T10 1164-1165 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001020 denotes à
T11 1166-1168 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001382 denotes 48
T12 1216-1218 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 denotes En
T13 1342-1344 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0008149 denotes Ne
T14 1358-1359 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001020 denotes à
T15 1609-1611 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 denotes En
T16 1814-1816 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0008149 denotes Ne
T17 1830-1831 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001020 denotes à
T18 1916-1918 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 denotes En
T19 1978-1980 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0008149 denotes ne
T20 2329-2331 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 denotes En
T21 2479-2481 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 denotes en
T22 2669-2670 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001020 denotes à
T23 2762-2764 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 denotes En
T24 2862-2864 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 denotes en
T25 2987-2989 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 denotes en
T26 3048-3050 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 denotes en
T27 3124-3126 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 denotes en
T28 3271-3273 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 denotes en
T29 3478-3481 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0002199 denotes car
T30 3695-3696 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001020 denotes à
T31 3843-3846 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001236 denotes 2 à
T32 3950-3952 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 denotes en
T33 3983-3985 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 denotes en
T34 4429-4431 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0003377 denotes FO
T35 4524-4526 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0008149 denotes ne
T36 4727-4729 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0008149 denotes ne
T37 4824-4826 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0008149 denotes ne
T38 4985-4986 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001020 denotes à
T39 5014-5015 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001020 denotes à
T40 5347-5348 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001020 denotes à
T41 5374-5376 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 denotes En
T42 5563-5564 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001020 denotes à
T43 5583-5585 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 denotes En
T44 6176-6178 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0008149 denotes ne

LitCovid-PD-CHEBI

Id Subject Object Predicate Lexical cue chebi_id
T1 237-239 Chemical denotes en http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_30347
T2 336-339 Chemical denotes Une http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_33361
T3 749-751 Chemical denotes La http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_33336
T4 808-810 Chemical denotes en http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_30347
T5 1292-1294 Chemical denotes Si http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_27573
T6 1342-1344 Chemical denotes Ne http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_33310
T7 1481-1484 Chemical denotes DXM http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_4470
T8 1487-1489 Chemical denotes Si http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_27573
T9 1563-1565 Chemical denotes Si http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_27573
T10 1734-1736 Chemical denotes Si http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_27573
T11 1814-1816 Chemical denotes Ne http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_33310
T12 2050-2052 Chemical denotes IV http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_74327
T13 2256-2258 Chemical denotes Si http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_27573
T14 2479-2481 Chemical denotes en http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_30347
T15 2862-2864 Chemical denotes en http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_30347
T16 2987-2989 Chemical denotes en http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_30347
T17 3048-3050 Chemical denotes en http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_30347
T18 3124-3126 Chemical denotes en http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_30347
T19 3271-3273 Chemical denotes en http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_30347
T20 3710-3712 Chemical denotes Si http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_27573
T21 3950-3952 Chemical denotes en http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_30347
T22 3973-3976 Chemical denotes Une http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_33361
T23 3983-3985 Chemical denotes en http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_30347
T24 4121-4130 Chemical denotes antiviral http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_22587
T25 4131-4133 Chemical denotes IV http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_74327
T26 4208-4210 Chemical denotes IV http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_74327
T27 4318-4320 Chemical denotes IV http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_74327
T28 4404-4406 Chemical denotes AV http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_73809
T29 4429-4431 Chemical denotes FO http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_43034|http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_74498
T31 5059-5061 Chemical denotes Si http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_27573

LitCovid-PD-GO-BP

Id Subject Object Predicate Lexical cue
T1 442-448 http://purl.obolibrary.org/obo/GO_0022810 denotes porter
T2 442-448 http://purl.obolibrary.org/obo/GO_0015297 denotes porter

LitCovid-sentences

Id Subject Object Predicate Lexical cue
T3 0-121 Sentence denotes L’uvéite touche une population d’âge variable avec un risque non négligeable de développer des formes graves du Covid-19.
T4 122-229 Sentence denotes Le recours aux stéroïdes ou immunosuppresseurs mérite des précautions et une évaluation du bénéfice-risque.
T5 231-258 Sentence denotes Prise en charge ambulatoire
T6 260-323 Sentence denotes En cas de premier épisode d’uvéite antérieure ou récidive aiguë
T7 324-335 Sentence denotes Attention :
T8 336-492 Sentence denotes Une consultation pour œil rouge peut correspondre à une conjonctivite Covid-19 et il est indispensable de porter des gants lors de l’examen de ces patients.
T9 493-610 Sentence denotes Le fond d’œil est indispensable pour éliminer les causes infectieuses classiques pouvant imposer une hospitalisation.
T10 611-748 Sentence denotes Il faut maintenir la consultation de contrôle à 48–72 heures (ou une semaine) puis la téléconsultation est à privilégier si amélioration.
T11 749-910 Sentence denotes La corticothérapie collyre n’est pas contre-indiquée, tout en favorisant une décroissance très lente de la corticothérapie afin d’éviter un rebond inflammatoire.
T12 911-1083 Sentence denotes En l’absence de signe général, ou d’immunodépression, avec atteinte unilatérale et amélioration rapide : le bilan étiologique pourra être réalisé sans urgence dans le mois.
T13 1084-1214 Sentence denotes Signe général, immunosuppression, atteinte bilatérale ou absence d’amélioration à 48 h : un bilan étiologique rapide est envisagé.
T14 1216-1291 Sentence denotes En cas d’uvéite antérieure suivie et traitée par collyres corticoïdes seuls
T15 1292-1320 Sentence denotes Si l'uvéite est stabilisée :
T16 1321-1341 Sentence denotes Pas de consultation.
T17 1342-1486 Sentence denotes Ne pas procéder à la décroissance des corticoïdes topiques et garder le nombre minimal de gouttes ayant permis l’accalmie (si < 5gtes/j de DXM).
T18 1487-1562 Sentence denotes Si PIO limite (> 20 mmHg) un hypotonisant prophylactique peut être proposé.
T19 1563-1608 Sentence denotes Si l'uvéite est non contrôlée : consultation.
T20 1609-1733 Sentence denotes En cas d’uvéite ou sclérite suivie et traitée par corticoïdes systémiques et/ou immunosuppresseurs et/ou agents biologiques.
T21 1734-1792 Sentence denotes Si uvéite chronique ou sclérite chronique ou stabilisées :
T22 1793-1813 Sentence denotes Pas de consultation.
T23 1814-1915 Sentence denotes Ne pas procéder à la décroissance des corticoïdes et garder la dose minimale ayant permis l’accalmie.
T24 1916-2134 Sentence denotes En l’absence d’argument pour une infection par le SARS-CoV-2, ne pas différer l’administration des immunosuppresseurs ou biothérapies IV s’il n’est pas possible de traiter l’inflammation par voie sous cutanée ou orale.
T25 2135-2255 Sentence denotes Les bilans sanguins de contrôle de la tolérance doivent être espacés si possible (si normalité sur les 2 derniers mois).
T26 2256-2314 Sentence denotes Si uvéite/sclérite non contrôlée ou avec menace visuelle :
T27 2315-2328 Sentence denotes Consultation.
T28 2329-2607 Sentence denotes En l’absence d’argument pour une infection par le SARS-CoV-2, des traitements anti-infectieux ou bolus de méthylprednisolone peuvent être administrés en hospitalisation après avoir pesé la balance bénéfice/risque (monophtalme, atteinte maculaire sévère ou du nerf optique etc…).
T29 2608-2760 Sentence denotes Dans les autres cas, les traitements stéroïdes locaux seront à privilégier pour permettre de différer le traitement systémique chez les patients Covid+.
T30 2762-2830 Sentence denotes En cas de kérato-uvéite herpétique ou rétinochoroïdite toxoplasmique
T31 2831-2980 Sentence denotes Pour le premier épisode : mise en route du traitement avec rythme de surveillance adapté au cas par cas et si possible sans corticothérapie associée.
T32 2981-3028 Sentence denotes Prise en charge spécialisée si menace visuelle.
T33 3029-3146 Sentence denotes Instaurer un suivi en téléconsultation pour modulation thérapeutique avec le cas échéant prise en charge spécialisée.
T34 3148-3178 Sentence denotes Les injections intravitréennes
T35 3179-3313 Sentence denotes Les IVT de corticoïdes pour œdème maculaire ou hyalite peuvent théoriquement être différées en l’absence de menace visuelle immédiate.
T36 3314-3425 Sentence denotes Elles seront discutées si situation d’urgence chez un patient Covid+ contre-indiquant le traitement systémique.
T37 3426-3553 Sentence denotes Privilégier les IVT aux injections sous-ténoniennes car la diffusion extraoculaire sanguine est quasi-nulle avec les premières.
T38 3554-3649 Sentence denotes Les IVT d’anti VEGF pour néovascularisation choroïdienne inflammatoire doivent être maintenues.
T39 3650-3709 Sentence denotes Comme pour la myopie forte un régime PRN est à privilégier.
T40 3710-3942 Sentence denotes Si impossibilité d’examiner le patient avant IVT (pour limiter le risque de contracter le SARS-CoV-2), un régime fixe mensuel court (2 à 3 mois maximum) peut être choisi si une seule IVT n’induit pas d’amélioration visuelle notable.
T41 3944-3972 Sentence denotes Prise en charge hospitalière
T42 3973-4135 Sentence denotes Une prise en charge hospitalière est envisagée dans ces cas :• endothélite herpétique ou zona ophtalmique de l’immunodéprimé imposant un traitement antiviral IV ;
T43 4136-4225 Sentence denotes • rétinites virales (aiguës) imposant des injections intravitréennes et IV d’antiviraux ;
T44 4226-4258 Sentence denotes • uvéites bactériennes sévères ;
T45 4259-4357 Sentence denotes • endophtalmies imposant des injections intravitréennes et IV d’antibiotiques ou d’antifongiques ;
T46 4358-4572 Sentence denotes • uvéite postérieure ou panuvéite sévère avec AV < 5/10, tyndall > 3+, FO non accessible ou hyalite > 2+, foyer ou nécrose rétinienne, menace maculaire ou papillaire ne pouvant pas bénéficier d’un traitement local.
T47 4574-4591 Sentence denotes Dans tous les cas
T48 4592-4689 Sentence denotes L’évaluation du patient atteint d’uvéite est consommatrice d’examens (flare, angiographies, OCT).
T49 4690-4788 Sentence denotes Il est demandé aux professionnels de ne les réaliser que si ces examens sont jugés indispensables.
T50 4789-5058 Sentence denotes Chez le patient supposé Covid-, il ne faut pas arrêter les traitements anti-infectieux, corticoïdes et/ou immunosuppresseurs et/ou biothérapies sous peine d’induire un rebond inflammatoire sévère à l’arrêt et donc un recours à des doses encore plus fortes de stéroïdes.
T51 5059-5192 Sentence denotes Si fièvre, ou toux ou signes respiratoires chez un patient sous corticoïdes systémiques ou immunosuppresseurs ou agents biologiques :
T52 5193-5373 Sentence denotes Consultation, prélèvement SARS-CoV-2 et arrêt transitoire des traitements immunosuppresseurs et/ou biologiques avec maintien d’une faible corticothérapie à discuter au cas par cas.
T53 5374-5582 Sentence denotes En cas d’uvéite nécessitant des corticoïdes et/ou des immunosuppresseurs et/ou des agents biologiques, il est préférable de retarder l’initiation du traitement systémique chez les patients à risque ou Covid+.
T54 5583-5655 Sentence denotes En cas de menace visuelle directe, la voie locale doit être privilégiée.
T55 5657-5676 Sentence denotes Rappel aux patients
T56 5677-5789 Sentence denotes Il est rappelé les règles ci-dessous aux patients :• respect des mesures barrières et de distanciation sociale ;
T57 5790-5870 Sentence denotes • si fièvre > 38°, prendre du paracétamol (maximum 3 g/j) mais éviter les AINS ;
T58 5871-6025 Sentence denotes • si signes infectieux de virose (malaise, toux, anosmie, agueusie, myalgies, diarrhées, céphalée, et/ou de fièvre > 38°), contacter le médecin référent ;
T59 6026-6120 Sentence denotes • si oppression thoracique et/ou essoufflement associés aux signes infectieux : appeler le 15.
T60 6122-6153 Sentence denotes Déclaration de liens d’intérêts
T61 6154-6209 Sentence denotes Les auteurs déclarent ne pas avoir de liens d’intérêts.

LitCovid-PD-HP

Id Subject Object Predicate Lexical cue hp_id
T2 5905-5912 Phenotype denotes malaise http://purl.obolibrary.org/obo/HP_0012378

LitCovid-PubTator

Id Subject Object Predicate Lexical cue tao:has_database_id
6 137-146 Chemical denotes stéroïdes
7 112-120 Disease denotes Covid-19 MESH:C000657245
10 483-491 Species denotes patients Tax:9606
11 406-414 Disease denotes Covid-19 MESH:C000657245
13 539-542 Gene denotes les Gene:2525
15 947-963 Disease denotes immunodépression
17 1516-1528 Disease denotes hypotonisant
23 2234-2237 Gene denotes les Gene:2525
24 2135-2138 Gene denotes Les Gene:2525
25 1966-1976 Species denotes SARS-CoV-2 Tax:2697049
26 1949-1958 Disease denotes infection MESH:D007239
27 2090-2102 Disease denotes inflammation MESH:D007249
36 2740-2743 Gene denotes les Gene:2525
37 2629-2632 Gene denotes les Gene:2525
38 2613-2616 Gene denotes les Gene:2525
39 2379-2389 Species denotes SARS-CoV-2 Tax:2697049
40 2744-2752 Species denotes patients Tax:9606
41 2645-2654 Chemical denotes stéroïdes
42 2362-2371 Disease denotes infection MESH:D007239
43 2753-2758 Disease denotes Covid MESH:C000657245
45 3148-3151 Gene denotes Les Gene:2525
51 3179-3182 Gene denotes Les Gene:2525
52 3539-3542 Gene denotes les Gene:2525
53 3438-3441 Gene denotes les Gene:2525
54 3368-3375 Species denotes patient Tax:9606
55 3376-3381 Disease denotes Covid MESH:C000657245
62 3569-3573 Gene denotes VEGF Gene:7422
63 3554-3557 Gene denotes Les Gene:2525
64 3741-3748 Species denotes patient Tax:9606
65 3800-3810 Species denotes SARS-CoV-2 Tax:2697049
66 3579-3624 Disease denotes néovascularisation choroïdienne inflammatoire
67 3873-3882 Disease denotes choisi si MESH:C538139
70 4450-4457 Chemical denotes hyalite
71 4473-4491 Chemical denotes nécrose rétinienne
73 4584-4587 Gene denotes les Gene:2525
77 4684-4687 Gene denotes OCT Gene:5362
78 4730-4733 Gene denotes les Gene:2525
79 4608-4615 Species denotes patient Tax:9606
83 4844-4847 Gene denotes les Gene:2525
84 4797-4804 Species denotes patient Tax:9606
85 4813-4818 Disease denotes Covid MESH:C000657245
88 5110-5117 Species denotes patient Tax:9606
89 5219-5229 Species denotes SARS-CoV-2 Tax:2697049
93 5550-5553 Gene denotes les Gene:2525
94 5554-5562 Species denotes patients Tax:9606
95 5575-5580 Disease denotes Covid MESH:C000657245
98 5860-5863 Gene denotes les Gene:2525
99 5809-5831 Chemical denotes prendre du paracétamol
101 5929-5947 Disease denotes agueusie, myalgies
104 5692-5695 Gene denotes les Gene:2525
105 5718-5726 Species denotes patients Tax:9606
107 6154-6157 Gene denotes Les Gene:2525