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PMC:7174190 / 230-3630 JSONTXT

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LitCovid-PD-FMA-UBERON

Id Subject Object Predicate Lexical cue fma_id
T3 140-147 Body_part denotes abdomen http://purl.org/sig/ont/fma/fma9577
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LitCovid-PD-UBERON

Id Subject Object Predicate Lexical cue uberon_id
T3 140-147 Body_part denotes abdomen http://purl.obolibrary.org/obo/UBERON_0000916
T4 1312-1319 Body_part denotes abdomen http://purl.obolibrary.org/obo/UBERON_0000916
T5 1809-1816 Body_part denotes abdomen http://purl.obolibrary.org/obo/UBERON_0000916

LitCovid-PD-MONDO

Id Subject Object Predicate Lexical cue mondo_id
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T5 434-442 Disease denotes COVID-19 http://purl.obolibrary.org/obo/MONDO_0100096
T6 628-636 Disease denotes COVID-19 http://purl.obolibrary.org/obo/MONDO_0100096
T7 1131-1135 Disease denotes SARS http://purl.obolibrary.org/obo/MONDO_0005091
T8 1568-1575 Disease denotes colitis http://purl.obolibrary.org/obo/MONDO_0005292
T9 2273-2281 Disease denotes COVID-19 http://purl.obolibrary.org/obo/MONDO_0100096
T10 2506-2514 Disease denotes COVID-19 http://purl.obolibrary.org/obo/MONDO_0100096
T11 3025-3033 Disease denotes COVID-19 http://purl.obolibrary.org/obo/MONDO_0100096

LitCovid-PD-CLO

Id Subject Object Predicate Lexical cue
T6 0-2 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0009126 denotes Sr
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T8 128-130 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 denotes en
T9 140-147 http://purl.obolibrary.org/obo/UBERON_0000916 denotes abdomen
T10 140-147 http://www.ebi.ac.uk/efo/EFO_0000968 denotes abdomen
T11 192-194 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 denotes en
T12 256-258 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 denotes en
T13 312-314 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 denotes en
T14 333-334 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001020 denotes a
T15 408-410 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 denotes en
T16 506-508 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 denotes en
T17 569-571 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0053755 denotes Es
T18 797-799 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0053755 denotes es
T19 1127-1130 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0002742 denotes del
T20 1136-1138 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 denotes en
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T40 3121-3122 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0001020 denotes A
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T43 3263-3265 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0053755 denotes es
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T45 3384-3386 http://purl.obolibrary.org/obo/CLO_0037161 denotes en

LitCovid-PD-CHEBI

Id Subject Object Predicate Lexical cue chebi_id
T1 0-2 Chemical denotes Sr http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_33324
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T3 128-130 Chemical denotes en http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_30347
T4 192-194 Chemical denotes en http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_30347
T5 225-230 Chemical denotes hemos http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_30413
T6 256-258 Chemical denotes en http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_30347
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T11 1136-1138 Chemical denotes en http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_30347
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T18 3097-3099 Chemical denotes en http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_30347
T19 3344-3350 Chemical denotes grupos http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_24433
T20 3384-3386 Chemical denotes en http://purl.obolibrary.org/obo/CHEBI_30347

LitCovid-sentences

Id Subject Object Predicate Lexical cue
T3 0-13 Sentence denotes Sr. Director:
T4 14-68 Sentence denotes Hemos leído el artículo publicado en su revista por R.
T5 69-154 Sentence denotes Blanco-Colino et al1. sobre la COVID-19 y su manifestación en forma de abdomen agudo.
T6 155-368 Sentence denotes Ante la situación actual de pandemia en la que estamos, los cirujanos hemos sido capaces de trabajar en equipo con diferentes especialidades y actualizarnos en diferentes campos a los que no estamos acostumbrados.
T7 369-568 Sentence denotes Muchos de los conocimientos adquiridos en cuanto al manejo de la COVID-19, han sido, por desgracia, primero improvisados y luego basados en protocolos que han ido cambiándose con relativa frecuencia.
T8 569-784 Sentence denotes Es conocido que un porcentaje no despreciable de pacientes COVID-19 positivos, tal y como refieren los autores, presentan síntomas gastrointestinales, entre los que destacan la anorexia, las diarreas y los vómitos2.
T9 785-946 Sentence denotes Aunque bien es cierto que la gran mayoría de ellos se acompañan de síntomas respiratorios o fiebre y rara vez se presenta como síntoma gastrointestinal aislado3.
T10 947-1034 Sentence denotes Ambas manifestaciones pueden coexistir sin necesidad de ser una dependiente de la otra.
T11 1035-1247 Sentence denotes No debemos olvidar que los síntomas gastrointestinales ya fueron descritos durante el brote del SARS en 20034, por lo que aunque se considere una nueva pandemia, ya teníamos información en la que poder apoyarnos.
T12 1248-1419 Sentence denotes El título del artículo puede malinterpretarse si entendemos por abdomen agudo, dolor abdominal repentino e intenso que requiere una actuación médica o quirúrgica urgente5.
T13 1420-1534 Sentence denotes La descripción que hacen los autores en el caso clínico no se ajusta a dicha definición ni a la práctica habitual.
T14 1535-1731 Sentence denotes El diagnóstico etiológico de una colitis infecciosa requiere de diferentes pruebas diagnósticas (cultivo de heces, estudio histológico, inmunohistoquímica…) dependiendo de la sospecha clínica6, 7.
T15 1732-1889 Sentence denotes Con los datos facilitados en la descripción del caso y con la radiografía de abdomen (véase leyenda de la imagen 1) no es posible realizar dicho diagnóstico.
T16 1890-2015 Sentence denotes En caso de que lo sospecharan, no encontramos la intención de realizar ninguna de las pruebas diagnósticas antes mencionadas.
T17 2016-2282 Sentence denotes Asimismo, se introducen diferentes conceptos como linfopenia o alteración en la analítica hepática (en pacientes ya tratados) que no tienen que ver con la finalidad del artículo: alertarnos de las supuestas manifestaciones gastrointestinales que provoca la COVID-19.
T18 2283-2524 Sentence denotes Dado que desconocemos el número absoluto de población infectada y que las estimaciones hacen pensar que son más que los casos reportados, es lógico sospechar que muchos de los pacientes que tratemos por otros motivos serán COVID-19 positivo.
T19 2525-2880 Sentence denotes Valoramos de forma positiva que los autores resalten la necesidad de realizar una buena anamnesis acerca de los síntomas respiratorios, de manera que se puedan extremar las precauciones y las medidas de aislamiento; aunque independientemente de pandemia o no, realizar una anamnesis completa a los pacientes debería ser mandatorio para cualquier cirujano.
T20 2881-3120 Sentence denotes Ante escenarios desconocidos, el reporte de casos clínicos puede ser de interés general, pero publicar prácticamente todo lo relacionado con la COVID-19, cuando la información no aporta soluciones se puede convertir en motivo de confusión.
T21 3121-3400 Sentence denotes A día de hoy, cuatro meses después del inicio del brote, las interacciones y el intercambio de información entre cirujanos por redes sociales es inmediato; se llevan a cabo encuestas y trabajos coordinados entre diferentes grupos de cirugía que ayudan e informan en mayor medida.

LitCovid-PD-HP

Id Subject Object Predicate Lexical cue hp_id
T1 746-754 Phenotype denotes anorexia http://purl.obolibrary.org/obo/HP_0002039
T2 1568-1575 Phenotype denotes colitis http://purl.obolibrary.org/obo/HP_0002583

LitCovid-PubTator

Id Subject Object Predicate Lexical cue tao:has_database_id
7 528-531 Gene denotes ido Gene:3620
8 454-457 Gene denotes por Gene:5447
9 62-65 Gene denotes por Gene:5447
10 100-108 Disease denotes COVID-19 MESH:C000657245
11 434-442 Disease denotes COVID-19 MESH:C000657245
20 1146-1149 Gene denotes por Gene:5447
21 648-651 Gene denotes tal Gene:6888
22 628-636 Disease denotes COVID-19 MESH:C000657245
23 691-718 Disease denotes síntomas gastrointestinales
24 746-754 Disease denotes anorexia MESH:D000855
25 907-944 Disease denotes como síntoma gastrointestinal aislado MESH:D005767
26 1062-1089 Disease denotes síntomas gastrointestinales
27 1131-1135 Disease denotes SARS MESH:D045169
31 1308-1311 Gene denotes por Gene:5447
32 1568-1586 Disease denotes colitis infecciosa MESH:D003092
33 2273-2281 Disease denotes COVID-19 MESH:C000657245
37 2482-2485 Gene denotes por Gene:5447
38 2506-2514 Disease denotes COVID-19 MESH:C000657245
39 2613-2659 Disease denotes anamnesis acerca de los síntomas respiratorios MESH:D005862
42 3244-3247 Gene denotes por Gene:5447
43 3025-3033 Disease denotes COVID-19 MESH:C000657245