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NameTDescription# Ann.AuthorMaintainer Updated_atStatus

1-20 / 316 show all
FirstAuthor_s_Plants For only Plants4.3 KAikoHIRAKI2023-11-29Testing
FirstAuthor10 FirstAuthor104.78 KAikoHIRAKI2023-11-29Developing
FA_Top100-Disease-keyword 94AikoHIRAKI2023-11-29Developing
CORD-19_HIRAKI HIRAKI Annotation for CORD-192.98 KAikoHIRAKI2023-11-29Testing
FirstAuthor_s 新着論文レビューで疾患名のあるレビューにおけるUniProtIDと薬剤等化合物日化辞ID (Japanese)39.3 KAikoHIRAKI2023-11-29Developing
Covid19_manual_annotation 5.1 KAikoHIRAKI2023-11-29Developing
FA_Top107-forWeb ※※※ !要データ加工! webリンク用には、この結果を加工して使っています。その他で使われる場合に、末尾記載の問題を別途解決する必要があります。 !要データ加工! ※※※ Top100+本来Top100に入るべきだった7レビューの計、107レビュー中99レビュー。 5414, 6076, 6930, 8403, 9643, 12112, 18544, 18829は、0denotationでドキュメント自体登録していません。 @AikoHIRAKIはtypoを修正したレビューフォルダ。 attributesの詳細はconfig参照。 ※※※ !注意! webリンク側のしばりで、選択文字列は複数のUniProtIDに対応していません。(例)Protein1~Protein7とある場合、 Protein1, 2, 3, 4, 5, 6, 7をさし、かつ全てにUniProtIDがあったとしても、1と7のみUniProtIDをとってきています。 "~"は、Protein2, 3, 4, 5, 6を意味していますが、positionではなく文字列で検索をかけているのと、見せ方の仕様上、これらのIDは全て未取得となっています。⇔GeneProteinでは"~"に2-6のIDsをもたせていました。 該当レビュー;14898(~=MAPK2, MAPK3, MAPK4, MAPK5, MAPK6), 10471(~=Ago2, Ago3) --------------------------------------- (例)ProteinAB...ProteinCD...ProteinB...ProteinDとある場合、 ProteinABは、ProteinAとBというLexical_Cueになっています。ProteinCDも同様に、ProteinCとD。BとDだけでは、このレビュー内ではProteinBやProteinDをさすことが分かるのですが、それ以外で使用する場合に、BとDにそれぞれ該当UniProtIDをあてるのは不適切です。 該当レビュー;11957(β4=itgb4, β1=itgb1, β5=itgb5, β3=itgb3) 他の例が出てきたら順次、ここに記載していきます。当座、これらは削除する必要があります。 attributeで削除フラグをつけるか、Jakeの機能がTextAEに実装されれば解決するか、検討して、何かしら分かるようにしておきます。 (例)ProteinA/B とある場合、 webリンクでは、"ProteinA"にUniProtID-Aを、"/B"にUniProtID-Bをつけています(リンク側のしばり)。webリンク以外で使われる場合には、別プロジェクトのFA_Top100Plus-GeneProteinで行っていたようなRelationを使って、"/B"ではなく、"ProteinB"として、UniProtID-Bと対応させる必要があります。現状のとり方ですと、要Relation箇所は救済出来ません。 Lexical cueには"/B"とありますが、Objectには"ProteinB"と残してあるので、Objectを参照して下さい。 但し、言語処理のようなpositionがご入用な場合には上では対応出来ていません。 該当レビュー;11935(/4=BMP4), 14898(/2=LATS2), 7412(/2=TSC2), 4629(/2=CtBP2) (webリンクでは、レビュー毎に完結しているので、"/B"がそのレビューで他の意味をなしていなければ対応出来るのと、文字列合致でリンクを貼っているためです。) !注意! ※※※ RelationのmergedはTextAEの既存機能で既に出来ます。10.3 KAikoHIRAKI2023-11-29Beta
FA_108-forWeb 12242,12112, 18829は、0denotationでドキュメント自体登録していない。 @AikoHIRAKIはtypoを修正したレビューフォルダ。50AikoHIRAKI2023-11-29Developing
FA_Top100Plus-Disease 2/2 FirstAuthor Top100+7 for diseases MONDO & HPO246AikoHIRAKI2023-11-29Testing
FA_PR25 FirstAuthor Protein Ontology 25 entries512AikoHIRAKI2023-11-29Developing
FA_Top100-Disease 1/2 FirstAuthor Top100 (201811-201910) for diseases MONDO & HPO2.14 KAikoHIRAKI2023-11-29
ASCO_abstracts asco abstracts sample dataset28 Kalo332023-11-29Testing
GGDB-2020 2.44 Kangata2023-11-30Developing
GlyCosmos600-GlycoGenes2 375angata2023-11-29Testing
Lectin 3.52 Kangata2023-11-28
TextMining-in-bioinformatics TextMining in bioinformatics0Aohnewug2020-04-21Developing
AlvisNLP-Test Project for testing AlviNLP PubAnnotation server during BLAH3.17Bibliome2023-11-29Testing
Test20200205 553BLAH6-Tweets2023-11-29Testing
SNPPhenoExt 3behrouz bokharaeianbokharaeian2023-11-29Developing
Test_PubTator 62Chih-Hsuan Wei2023-11-29Testing
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