Constitutive Cassete Multiple Splice Intron Retention All Exons Sens Spec Sens Spec Sens Spec Sens Spec Sens Spec ExAlt-Exon 100 96 100 89 67 94 61 89 84 94 Ex Alt-Exon- ab initio 100 88 100 85 69 83 70 87 87 84 ExAlt-Frame 96 95 70 80 53 87 48 82 72 89 Ex Alt- Frame- ab initio 97 87 72 74 56 76 48 80 74 82 ExAlt-Frame-Single 96 97 69 85 45 92 31 92 66 94 ExAlt-Default 89 84 58 63 49 77 43 74 67 79 Ex Alt-Default-ab initio 89 75 58 55 50 67 36 58 65 69 ExAlt-Default-Single 89 90 56 66 41 84 28 83 61 85 N-SCAN 87 84 51 80 33 66 31 66 57 78 Augustus 75 77 27 53 27 59 26 57 47 69 SNAP 76 72 42 61 29 56 27 62 50 67