De nombreuses souches de coronavirus ont été isolées chez différents animaux, chaque virus étant nommé en fonction de son hôte et de l'éventuelle pathologie associée : avian infectious bronchitis virus (IBV), mouse hepatitis virus (MHV), bovine coronavirus (BCV) transmissible gastroenteritis virus of swine (TGEV), porcine respiratory coronavirus (PRCV), rat coronavirus (RCV) etc. [21] .