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FA_Top100Plus-GeneProtein Top100+本来Top100に入るべきだった7レビューの計、107レビュー中101レビュー。 5414, 6076, 6930, 8403, 9643, 18544は、0denotationでドキュメント自体登録していない。 @AikoHIRAKIはtypoを修正したレビューフォルダ。 attributesの詳細はconfigか、doc参照。但し、docはその他のprojectについても書いてある(webリンクの箇所は古い)ので、該当するFA_Top100Plus-GeneProteinのみを参照。 ※※※ !未処理注意! このまま結果が即使える状態ではありません。上を参照にデータ加工下さい。 !未処理注意! ※※※ 済 ※※※ !未処理注意! 18773にtypoが見つかったので、web版から正しいtxtを取り直して、位置を直す必要がある。 !未処理注意! ※※※ 10.6 KAikoHIRAKI2020-06-07Beta
FA_Top107-forWeb ※※※ !要データ加工! webリンク用には、この結果を加工して使っています。その他で使われる場合に、末尾記載の問題を別途解決する必要があります。 !要データ加工! ※※※ Top100+本来Top100に入るべきだった7レビューの計、107レビュー中99レビュー。 5414, 6076, 6930, 8403, 9643, 12112, 18544, 18829は、0denotationでドキュメント自体登録していません。 @AikoHIRAKIはtypoを修正したレビューフォルダ。 attributesの詳細はconfig参照。 ※※※ !注意! webリンク側のしばりで、選択文字列は複数のUniProtIDに対応していません。(例)Protein1~Protein7とある場合、 Protein1, 2, 3, 4, 5, 6, 7をさし、かつ全てにUniProtIDがあったとしても、1と7のみUniProtIDをとってきています。 "~"は、Protein2, 3, 4, 5, 6を意味していますが、positionではなく文字列で検索をかけているのと、見せ方の仕様上、これらのIDは全て未取得となっています。⇔GeneProteinでは"~"に2-6のIDsをもたせていました。 該当レビュー;14898(~=MAPK2, MAPK3, MAPK4, MAPK5, MAPK6), 10471(~=Ago2, Ago3) --------------------------------------- (例)ProteinAB...ProteinCD...ProteinB...ProteinDとある場合、 ProteinABは、ProteinAとBというLexical_Cueになっています。ProteinCDも同様に、ProteinCとD。BとDだけでは、このレビュー内ではProteinBやProteinDをさすことが分かるのですが、それ以外で使用する場合に、BとDにそれぞれ該当UniProtIDをあてるのは不適切です。 該当レビュー;11957(β4=itgb4, β1=itgb1, β5=itgb5, β3=itgb3) 他の例が出てきたら順次、ここに記載していきます。当座、これらは削除する必要があります。 attributeで削除フラグをつけるか、Jakeの機能がTextAEに実装されれば解決するか、検討して、何かしら分かるようにしておきます。 (例)ProteinA/B とある場合、 webリンクでは、"ProteinA"にUniProtID-Aを、"/B"にUniProtID-Bをつけています(リンク側のしばり)。webリンク以外で使われる場合には、別プロジェクトのFA_Top100Plus-GeneProteinで行っていたようなRelationを使って、"/B"ではなく、"ProteinB"として、UniProtID-Bと対応させる必要があります。現状のとり方ですと、要Relation箇所は救済出来ません。 Lexical cueには"/B"とありますが、Objectには"ProteinB"と残してあるので、Objectを参照して下さい。 但し、建石さんのようなpositionがご入用な場合には上では対応出来ていません。 該当レビュー;11935(/4=BMP4), 14898(/2=LATS2), 7412(/2=TSC2), 4629(/2=CtBP2) (webリンクでは、レビュー毎に完結しているので、"/B"がそのレビューで他の意味をなしていなければ対応出来るのと、文字列合致でリンクを貼っているためです。) !注意! ※※※ RelationのmergedはTextAEの既存機能で既に出来ます。10.3 KAikoHIRAKI2020-06-15Beta
IMDB-NLP Annotations for chunking and semantic role labeling based on in-memory databases.02016-05-06Uploading
AnEM_full-texts 250 documents selected randomly from full-text papers Entity types: organism subdivision, anatomical system, organ, multi-tissue structure, tissue, cell, developing anatomical structure, cellular component, organism substance, immaterial anatomical entity and pathological formation Together with AnEM_abstracts, it is probably the largest manually annotated corpus on anatomical entities.689NaCTeMYue Wang2016-07-27Uploading
CoGe_Citation_Annotations Annotated PMC abstracts+full articles, that cite the "CoGe" papers (PMID: 18952863, 18269575). Total Num Citations: 165 Total Num Unique Citations: 141 Total Num Abstracts: 165 Total Num Whole Articles: 165 0Heather Lenthclent2016-10-11Uploading
OryzaGP1 A dataset for Named Entity Recognition for rice gene0Huy Do. Pierre Larmande2019-01-31Uploading
OryzaGP A dataset for Named Entity Recognition for rice gene29.1 KHuy Do and Pierre LarmandeYue Wang2019-03-13Uploading
tagtog OpenAccess annotations coming from tagtog.net0tagtogtagtog2015-02-23Developing
NFkB_GeneID Assignment of Entrez Gene IDs to the gene-references appearing in PMC full texts.2.31 KYo Shidahara2015-02-26Developing
KAIST_NLP_Annotation3 4.73 Kkaist_nlp2015-09-21Developing
KAIST_NLP_Annotation4 5.18 Kkaist_nlp2015-09-21Developing
KAIST_NLP_Annotation5 6.27 Kkaist_nlp2015-09-21Developing
KAIST_NLP_Annotation6 4.47 Kkaist_nlp2015-09-21Developing
KAIST_NLP_Annotation7 4.64 Kkaist_nlp2015-09-21Developing
KAIST_NLP_Annotation9 6.32 Kkaist_nlp2015-09-21Developing
KAIST_NLP_Annotation10 4.76 Kkaist_nlp2015-09-21Developing
KAIST_NLP_Annotation11 4.88 Kkaist_nlp2015-09-21Developing
KAIST_NLP_Annotation12 5 Kkaist_nlp2015-09-21Developing
KAIST_NLP_Annotation13 6.27 Kkaist_nlp2015-09-21Developing
KAIST_NLP_Annotation8 5.02 Kkaist_nlp2015-10-02Developing
NameT# Ann.AuthorMaintainerUpdated_atStatus

81-100 / 381 show all
FA_Top100Plus-GeneProtein 10.6 KAikoHIRAKI2020-06-07Beta
FA_Top107-forWeb 10.3 KAikoHIRAKI2020-06-15Beta
IMDB-NLP 02016-05-06Uploading
AnEM_full-texts 689NaCTeMYue Wang2016-07-27Uploading
CoGe_Citation_Annotations 0Heather Lenthclent2016-10-11Uploading
OryzaGP1 0Huy Do. Pierre Larmande2019-01-31Uploading
OryzaGP 29.1 KHuy Do and Pierre LarmandeYue Wang2019-03-13Uploading
tagtog 0tagtogtagtog2015-02-23Developing
NFkB_GeneID 2.31 KYo Shidahara2015-02-26Developing
KAIST_NLP_Annotation3 4.73 Kkaist_nlp2015-09-21Developing
KAIST_NLP_Annotation4 5.18 Kkaist_nlp2015-09-21Developing
KAIST_NLP_Annotation5 6.27 Kkaist_nlp2015-09-21Developing
KAIST_NLP_Annotation6 4.47 Kkaist_nlp2015-09-21Developing
KAIST_NLP_Annotation7 4.64 Kkaist_nlp2015-09-21Developing
KAIST_NLP_Annotation9 6.32 Kkaist_nlp2015-09-21Developing
KAIST_NLP_Annotation10 4.76 Kkaist_nlp2015-09-21Developing
KAIST_NLP_Annotation11 4.88 Kkaist_nlp2015-09-21Developing
KAIST_NLP_Annotation12 5 Kkaist_nlp2015-09-21Developing
KAIST_NLP_Annotation13 6.27 Kkaist_nlp2015-09-21Developing
KAIST_NLP_Annotation8 5.02 Kkaist_nlp2015-10-02Developing