> top > projects

Projects

NameTDescription# Ann.Author MaintainerUpdated_atStatus

361-380 / 556 show all
bionlp-ost-19-BB-norm-test 2.05 Kldeleger2023-11-28Developing
Training_Data_English_ru_en 0wmtbio2023-11-29Developing
FA_Top107-forWeb ※※※ !要データ加工! webリンク用には、この結果を加工して使っています。その他で使われる場合に、末尾記載の問題を別途解決する必要があります。 !要データ加工! ※※※ Top100+本来Top100に入るべきだった7レビューの計、107レビュー中99レビュー。 5414, 6076, 6930, 8403, 9643, 12112, 18544, 18829は、0denotationでドキュメント自体登録していません。 @AikoHIRAKIはtypoを修正したレビューフォルダ。 attributesの詳細はconfig参照。 ※※※ !注意! webリンク側のしばりで、選択文字列は複数のUniProtIDに対応していません。(例)Protein1~Protein7とある場合、 Protein1, 2, 3, 4, 5, 6, 7をさし、かつ全てにUniProtIDがあったとしても、1と7のみUniProtIDをとってきています。 "~"は、Protein2, 3, 4, 5, 6を意味していますが、positionではなく文字列で検索をかけているのと、見せ方の仕様上、これらのIDは全て未取得となっています。⇔GeneProteinでは"~"に2-6のIDsをもたせていました。 該当レビュー;14898(~=MAPK2, MAPK3, MAPK4, MAPK5, MAPK6), 10471(~=Ago2, Ago3) --------------------------------------- (例)ProteinAB...ProteinCD...ProteinB...ProteinDとある場合、 ProteinABは、ProteinAとBというLexical_Cueになっています。ProteinCDも同様に、ProteinCとD。BとDだけでは、このレビュー内ではProteinBやProteinDをさすことが分かるのですが、それ以外で使用する場合に、BとDにそれぞれ該当UniProtIDをあてるのは不適切です。 該当レビュー;11957(β4=itgb4, β1=itgb1, β5=itgb5, β3=itgb3) 他の例が出てきたら順次、ここに記載していきます。当座、これらは削除する必要があります。 attributeで削除フラグをつけるか、Jakeの機能がTextAEに実装されれば解決するか、検討して、何かしら分かるようにしておきます。 (例)ProteinA/B とある場合、 webリンクでは、"ProteinA"にUniProtID-Aを、"/B"にUniProtID-Bをつけています(リンク側のしばり)。webリンク以外で使われる場合には、別プロジェクトのFA_Top100Plus-GeneProteinで行っていたようなRelationを使って、"/B"ではなく、"ProteinB"として、UniProtID-Bと対応させる必要があります。現状のとり方ですと、要Relation箇所は救済出来ません。 Lexical cueには"/B"とありますが、Objectには"ProteinB"と残してあるので、Objectを参照して下さい。 但し、言語処理のようなpositionがご入用な場合には上では対応出来ていません。 該当レビュー;11935(/4=BMP4), 14898(/2=LATS2), 7412(/2=TSC2), 4629(/2=CtBP2) (webリンクでは、レビュー毎に完結しているので、"/B"がそのレビューで他の意味をなしていなければ対応出来るのと、文字列合致でリンクを貼っているためです。) !注意! ※※※ RelationのmergedはTextAEの既存機能で既に出来ます。10.3 KAikoHIRAKI2023-11-29Beta
FA_Top100Plus-Disease 2/2 FirstAuthor Top100+7 for diseases MONDO & HPO246AikoHIRAKI2023-11-29Testing
CORD-19-sample-CHEBI 16Jin-Dong Kim2023-11-29Developing
Training_Data_Russian_ru_en 0wmtbio2023-11-29Developing
LitCovid-sample-DRON 0Jin-Dong Kim2023-11-29Testing
LitCovid-sample-CHEBI 1.44 KJin-Dong Kim2023-11-29Testing
SMAFIRA-Case-Studies-16850029 From: https://github.com/SMAFIRA/c_corpus/blob/master/SMAFIRAc_0.4_Annotations.csv0zebet2023-11-30Developing
LitCoin-SeqVar 810shuo502023-11-29Testing
LitCoin-NCBITaxon-2 1.65 Katsuko2023-11-29Testing
SMAFIRA-Case-Studies-19735549 From: https://github.com/SMAFIRA/c_corpus/blob/master/SMAFIRAc_0.4_Annotations.csv0zebet2023-11-30Developing
LitCoin-PubTator-for-Tuning-SeqVar 127shuo502023-11-29Testing
Text-Annotation 02022-01-17
Oncogenesis 0Sophie Nam2023-11-26
med-device 434laurenc2023-11-27Developing
blah6 device Annotator374slee72682023-11-28Testing
funRiceGenes-exact 841Yue Wang2023-11-28Developing
Bioinformatics_fulltext 0Sophie Nam2023-11-28Uploading
TEST-DiseaseOrPhenotypicFeature Annotated by Mesh_All_FN795Eisuke Dohi2023-11-29Released
NameT# Ann.Author MaintainerUpdated_atStatus

361-380 / 556 show all
bionlp-ost-19-BB-norm-test 2.05 Kldeleger2023-11-28Developing
Training_Data_English_ru_en 0wmtbio2023-11-29Developing
FA_Top107-forWeb 10.3 KAikoHIRAKI2023-11-29Beta
FA_Top100Plus-Disease 246AikoHIRAKI2023-11-29Testing
CORD-19-sample-CHEBI 16Jin-Dong Kim2023-11-29Developing
Training_Data_Russian_ru_en 0wmtbio2023-11-29Developing
LitCovid-sample-DRON 0Jin-Dong Kim2023-11-29Testing
LitCovid-sample-CHEBI 1.44 KJin-Dong Kim2023-11-29Testing
SMAFIRA-Case-Studies-16850029 0zebet2023-11-30Developing
LitCoin-SeqVar 810shuo502023-11-29Testing
LitCoin-NCBITaxon-2 1.65 Katsuko2023-11-29Testing
SMAFIRA-Case-Studies-19735549 0zebet2023-11-30Developing
LitCoin-PubTator-for-Tuning-SeqVar 127shuo502023-11-29Testing
Text-Annotation 02022-01-17
Oncogenesis 0Sophie Nam2023-11-26
med-device 434laurenc2023-11-27Developing
blah6 374slee72682023-11-28Testing
funRiceGenes-exact 841Yue Wang2023-11-28Developing
Bioinformatics_fulltext 0Sophie Nam2023-11-28Uploading
TEST-DiseaseOrPhenotypicFeature 795Eisuke Dohi2023-11-29Released